江南医庐“杏林堂”中不起眼的女学徒艾子衿因一桩命案牵扯进东林党漩涡中。东林党人乔之甦为得名册而入府台唐府。艾子衿惊觉乔之甦乃多年前已死的丈夫。多年前，乔府当家乔老太爷为御医之首，却卷入红丸案，受冤下狱。
乔之甦与艾子衿相逢不相认，更因当年冤枉对艾子衿怨恨颇深，直至江南瘟疫爆发，二人共同入疫区救人，方才误会冰释。艾子衿恩师林德伊染疫病，临终前吐露红丸秘事。后乔之甦找到药方，却因为无药可用，情急之下，送艾子衿出城寻药。
艾子衿初恋**沈斯受帝命南巡至此，将艾子衿带回京城，幸乔之甦师妹孙九妹及时送来草药才解了一城毒疫。
乔之甦发觉有人利用红丸控制无辜百姓，为寻真相前往京城，被信王推荐